动物科技学院顾京晶在《Molecular Ecology Resources》发表马三维基因组研究论文(图)

时间: 2023/06/05   作者:顾京晶      来源:动物科技学院   编辑:新闻中心1   点击:

本网讯(动物科技学院 顾京晶)5月31日,动物科技学院副教授顾京晶在国际著名期刊Molecular Ecology Resources(中科院生物学大类1区Top期刊)发表题为“Genetic variation and domestication of horses revealed by 10 chromosome-level genomes and whole-genome resequencing”的研究论文。湖南农业大学动物科技学院为该论文的第一单位,顾京晶为论文的第一作者兼通讯作者,中国科学院昆明动物所研究员吴东东、云南大学研究员李艳为本文的共同通讯作者。

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论文中组装的十个全球代表性马种

本研究首次在染色体水平上从头组装出10个全球代表马种(纯血马,阿拉伯马,阿哈尔捷金马,蒙古马,弗里斯兰马,设特兰矮马,安达卢西亚马,德宝矮马,夸特马,克里奥罗马)的三维基因组,并结合群体高深度重测序,对马基因组上的大片段结构变异(SV)和三维染色质拓扑相关结构域(TAD)进行了全面解析,为马的分子育种提供了有力的科学依据。全球赛马业最主要的比赛用马——纯血马是本次研究的重点关注马种,每年涉及的相关产业已经超过千亿欧元。

本研究首次发现了在纯血马中与心脏发育和骨骼肌收缩等运动性状显著相关的ADA, IFT88, MYH8, JPH2, SNTA1, KDM6A, ROBO1等基因中,TAD内部存在影响蛋白编码的结构变异(SV),这是纯血马这一马种特有的。研究结果同时表明,在胰岛素诱导的糖原合成中起重要作用的PDK1基因中,一个大片段SV在纯血马群体中的频率明显高于其他马种。本研究得到了国家自然科学基金(31501000)的资助。

论文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/1755-0998.13818

(审稿人:庹炼)

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